سال ها پیش، مرگ امپراتور باعث شورش ها و جنگ های داخلی شد که آتلانتیا را ویران کرد. پس از به تخت نشستن شاه جوان یابا، شورشیان خیانتکار اعدام شدند تا آرامشی را که زمانی کشور داشت، بازگردانند. با این حال، آتلانتیا، آلوده به این اقدام رادیکال حکومت، همچنان در زیر سایه حکومت ظالمانه قرار دارد.
Tsurugi Tatewaki یک نوجوان بداخلاق است که در حومه شهر با خاطره کمی از والدینش بزرگ شده است. او یک روز در خانه اش با شمشیری مرموز روبرو می شود که به کارت Battle Spirits تبدیل می شود. هنگامی که نیروهای مسلح آتلانتیس با Tsurugi روبرو می شوند و سعی می کنند کارت او را پس بگیرند، به نظر می رسد رازهای پشت گذشته Tsurugi فاش شود.
Tsurugi با همراهی یک دروید به نام برینگر، راه خود را به سمت پایتخت آتلانتیا می‌رود و با جنگجویان احتمالی با شمشیرهای مشابه روبرو می‌شود. از آنجایی که دنیای او با ظهور تدریجی اسرار بزرگ‌تر به آرامی زیر و رو می‌شود، سورگی ممکن است مجبور شود همه چیزهایی را که می‌داند، از جمله قضاوت خودش در مورد آنچه که خوب را از بد جدا می‌کند، زیر سوال ببرد.
