در سال 2015، سازمان امنیت کلده از کارشناسان هر دو حوزه جادویی و دنیوی استفاده می کند تا آینده بشریت را برای رویدادهای احتمالی انقراض مشاهده کنند. به نظر می رسد بقای بشر برای قرن آینده تضمین شده باشد - تا زمانی که حکم ناگهان تغییر کند، و اکنون ریشه کن شدن گونه در پایان سال 2016 در انتظار است. علت ناشناخته است، اما به نظر می رسد با شهر ژاپنی فویوکی و وقایع سال 2004 مرتبط باشد. پنجمین جنگ جام مقدس
در پاسخ، Chaldea از یک وسیله آزمایشی برای سفر در زمان، فناوری Rayshift استفاده می کند. با آن، Ritsuka Fujimaru، مرد جوانی که به تازگی در سازمان استخدام شده است، و دختر مرموز Mash Kyrielight، می توانند به سال 2004 سفر کنند و کشف کنند که چگونه بشریت را نجات دهد. یک دستور بزرگ برای مبارزه با سرنوشت اعلام شده است - دستوری برای تغییر گذشته و بازگرداندن آینده.
