این فیلم رویارویی بین مرد آهنی و ازکیل استن شرور را بررسی می‌کند که فناوری زیستی جدیدی را توسعه می‌دهد که ظاهراً از زره مرد آهنی پیشی می‌گیرد. پس از اینکه استن یک حمله تروریستی را آغاز می کند و تونی استارک را برای سقوط قرار می دهد، مرد آهنی باید از شکار مرد شیلد فرار کند و راهی برای پاک کردن نام خود پیدا کند.
