یک قرن از زمانی که "جادوی واقعی" - که در ابتدا تصور می شد صرفاً فولکلور و افسانه است - به فناوری رایج در سراسر جهان تبدیل شده است می گذرد. اولین دبیرستان وابسته به دانشگاه ملی جادو (اولین دبیرستان)، یکی از نه آکادمی جادو در ژاپن، دو خواهر و برادر ماهر - میوکی و تاتسویا شیبا - را در آکادمی می پذیرد. First High دانش آموزان خود را بر اساس نمرات کنکور به دو گروه دوره 1 و دوره 2 تقسیم می کند. این امر باعث تحقیر آشکار دانش‌آموزان دوره 2 می‌شود، زیرا دانش‌آموزان دوره 1 به آنها برچسب "علف‌های هرز" می‌زنند، که خود را "شکوفه‌ها" می‌نامند.
تاتسویا در دوره 2 پذیرفته می شود، در حالی که خواهرش میوکی به عنوان دانشجوی ممتاز به دوره 1 می پیوندد. میوکی مایل است به First High نشان دهد که علیرغم اینکه برادرش به عنوان نالایق برچسب خورده است، او یکی از بهترین جادوگران در کل جهان است.
Mahouka Koukou no Yuutousei داستان Mahouka Koukou no Rettousei را از دیدگاه میوکی و دیگر شخصیت‌های زن بازگو می‌کند.
