موجودات مرموز و ناشناخته ای که با قوانین طبیعت بیگانه هستند - که فقط برخی از آنها می شناسند و برخی دیگر از آنها می ترسند - "موشی" در پشت بسیاری از پدیده های عجیب زندگی نهفته است.
مدتها پیش، یک موشی با قدرت وحشتناک تهدید به خاموش شدن همه زندگی کرد. طایفه مینایی موشیشی از کسانی که این نیروی بدخواه را متوقف کردند، متولد شدند، اعضای آنها وظیفه داشتند به عنوان نگهبان خانواده کاریبوسا، که موشی در درون آنها مهر و موم شده است، خدمت کنند. Mushishi Ginko از Tanyuu Karibusa درخواست شغلی دریافت می کند: نظارت بر کار رئیس قبیله Minai، Kumado Minai، در تحقیق در مورد یک دهکده متروکه که در آن چوب های مرده و حتی خانه ها به عنوان گیاهان شکوفا به زندگی باز می گردند.
اگرچه طایفه مینایی در بین موشیشی به طرز عجیبی بی رحم هستند، اما عجیب تر از آن، شخصیت کسل کننده گسترده آنهاست که قدردانی کمی از زیبایی یا احساسات دارند. تانیو بر این باور است که این روند بیش از آنچه که به نظر می رسد وجود دارد. جینکو قصد دارد به کنجکاوی او پاسخ دهد زیرا کومادو را به سمت «مسیر خارها» دنبال می‌کند، جایی که موشی از منابع عجیب خود به دنیای زندگان سرازیر می‌شود. گونه های کمیاب و کشنده موشی در این اعماق کمین کرده اند، همراه با ماهیت مخفی عزم قبیله مینایی برای انجام وظیفه باستانی خود.
