همانطور که جنگ ماشینی پیشرفت می کند، فرماندهی YoRHa و مقاومت برای یک حمله قطعی نهایی علیه "Machine Lifeforms"، روبات های نظامی شده ای که در سطح زمین پرسه می زنند، آماده می شوند. در حالی که آماده سازی در حال انجام است، YoRHa 9-gou S-gata "9S" و YoRHa 2-gou B-gata "2B" به ماموریت پیشاهنگی پیشرفته خود ادامه می دهند. با این حال، 9S و 2B با نقش های مربوطه، وفاداری خود به یکدیگر و وفاداری خود به فرماندهی مبارزه می کنند.
اگرچه آدم و حوا شرور شکست خورده اند، به نظر می رسد که ماشین ها برای شمارش کم نیستند. حضوری شوم در قالب «دختر قرمز» همچنان از دور اندرویدها را رصد می کند و منتظر فرصتی عالی برای حمله به آن هاست.