سالها پس از شکست امپراتوری خزندگان، تیم گتر آموزش روی یک ربات فوقالعاده جدید به نام نئو گتر روبو را آغاز کرده است. اما یک حمله غافلگیرانه از سوی رهبر احیا شده امپراتوری آنها باید تا یک مبارز خیابانی به نام گو ایچیمونجی را به عنوان خلبان گتر و آن استفاده کنند. در مقابله با دشمنی بسیار قدرتمند، تنها امید تیم جدید برای پیروزی ممکن است در احیای سلاح گمشده بشریت، Shin Getter Robo باشد.