گامیلانی ها با بزرگترین مانع خود روبرو هستند: سیاره آنها با سرعتی نگران کننده در حال مرگ است. آبرد دسلر برای نجات مردمش و نقل مکان آنها به سرزمین قابل سکونت، تظاهر به تسلیم شدن در برابر حکومت ظالمانه سیاره گالمان می کند که نژادی تقریباً مشابه با گامیلان ها را در خود جای داده است. هدف واقعی دزلر در دست گرفتن کنترل و تسریع نجات کشورش است. با این حال، زمانی که گامیلانها مهاجرت خود را آغاز میکنند، یک قدرت عظیم ناشناس به آنها حمله میکند و سیاره دوقلوی آنها - ایسکاندار، خانه ملکه استارشا را کاملاً منحرف میکند.
در همین حال، زمین در حال جشن گرفتن موفقیت کشتی جنگی فضایی باشکوه یاماتو و خدمه قهرمان آن است. نسل جدیدی از نیروهای امیدوار به یاماتو و دو کشتی جدید پشتیبانی آن به رهبری یوکی موری و شیرو سانادا می پیوندند. اما همه با تصمیمات گذشته کاپیتان آن، سوسومو کودای موافق نیستند. در طول ماموریت آموزشی شش ماهه یاماتو و ملاقات دیپلماتیک با گامیلان ها، خدمه از فاجعه اخیر باخبر می شوند و برخلاف همه دستورات، کودای ناوگان را برای کمک به پناهندگان بازمانده به ایسکاندار فرمان می دهد.