در آینده ای نزدیک، با ظهور موجودات مرموز به نام "Huge"، بشریت در آستانه نابودی است. زنان جوانی به نام "لیلی ها" با استفاده از سلاح های پیشرفته ای به نام "CHARM" به مبارزه برای نجات آنچه باقی مانده است ادامه می دهند. باغ ها، موسسات آموزشی لیلی، در سراسر جهان تأسیس شدند و به پایگاه های مقاومت در برابر عظیم تبدیل شدند. ریری هیتوتسویاناگی، یک دانشجوی جدید در آکادمی دخترانه یوریگائوکا، یکی از باغ های متعدد در منطقه توکیو، تیم هیتوتسویاناگی را با دوستان تازه یافته اش تشکیل داد و با آنها برای یک ماموریت ویژه به توکیو سفر کرد. سرنوشت آکادمی دخترانه یوریگائوکا، آکادمی دخترانه لودویک، آکادمی دخترانه هرنسوگ، مدرسه هنرهای دخترانه کانبا، مدرسه دخترانه اودایبا و دبیرستان زنان ساگامی شروع به تلاقی می کند...
