در شهر لوهتا، جشنواره ای برای ستایش «هارون قهرمان موج» برگزار می شود که بر اساس افسانه ای که از نسل های شهر گذشت، قرن ها پیش با استفاده از قدرت «درخت خاستگاه جهان» جنگ را متوقف کرد. ساتوشی و پیکاچو در نبردی برای تعیین قهرمان امسال شرکت می کنند و پس از پیروزی به عنوان "قهرمان رهبر موج" انتخاب می شوند. یک مهمانی رقص بزرگ در قلعه برای جشن گرفتن پیروز برگزار می شود، اما ناگهان پوکمون میو فانتوم ظاهر می شود و پیکاچو را می گیرد. به زودی پس از آن، Wave Leader Pokemon "Lucario" از مهر قرن ها خود آزاد می شود و با ساتوشی ملاقات می کند. ساتوشی باید اسرار مختلفی را حل کند که پیکاچو کجاست، میو چه چیزی را دنبال می کند، راز افسانه رهبر موج چیست و چگونه با لوکاریو پیوند می خورد. زمانی که او با لوکاریو به «درخت خاستگاه جهان» می‌رود، گذشته پنهانی دارد.
