خلاصه
مستعمره فضایی "خنثی" هلیوپولیس، Morgenroete را در خود جای داده است، یک مرکز تحقیقاتی اسلحه فوق سری که متخصص در تولید کشتی جنگی Archangel و پنج نمونه اولیه Gundam برای نیروی اتحاد زمین است. ZAFT، ارتش شورشی متشکل از انسان های اصلاح شده ژنتیکی شناخته شده به عنوان هماهنگ کننده، به هلیوپولیس حمله می کند و چهار نمونه از پنج نمونه اولیه را می دزدد. کیرا یاماتو غیرنظامی، هماهنگ کننده ای که توسط والدین طبیعی بزرگ شده است، در طول حمله به گاندام Strike برخورد می کند. او برای محافظت از دوستان طبیعی خود لباس متحرک نیروی اتحاد زمین را خلبان می کند و خود را درگیر نبرد مرگبار با بهترین دوست دوران کودکی خود، هماهنگ کننده آترون زالا می بیند که اکنون یک خلبان ACE برای ZAFT است. دوستی آنها تنها چیزی نیست که در خطر است. بقای یک نژاد کامل به نتیجه این جنگ بستگی دارد.