دایمون کایتو، متعصب به پازل، در تمام زندگی خود دیوانه حل بازی های فکری، پازل ها و معماها بوده است. او با Nonoha در آکادمی معتبر روت شرکت می کند، اما بیشتر وقت خود را صرف ایجاد و حل پازل می کند. کایتو یکی از معدود نوجوانان نابغه ای است که به همراه سایر همکلاسی های باهوش خود که به آنها القاب گالیله، ادیسون و داوینچی لقب انیشتین داده اند، به مدرسه می روند. آنها با هم تلاش می کنند تا معمایی را حل کنند که از زمان ایجاد آن قرن ها پیش، هرگز حل نشده است. اما دانش آموزان نابغه به زودی متوجه می شوند که نیروهای خطرناکی در پشت این پازل غیرممکن وجود دارد.