Utena Tenjou به آکادمی Ohtori می رسد، اما بلافاصله در یک سری دوئل برای دست همکلاسی خود Anthy Himemiya و قدرتی که ظاهراً در اختیار دارد، جذب می شود. در همان زمان، Utena دوباره با Touga Kiryuu، دوست دوران کودکی خود که به نظر می رسد رازهای پشت دوئل ها را می داند، متحد می شود.