سالها پس از اینکه پسر جوانی در آمریکا یکی از دوستان دیجیمون خود را از دست داد، یک دیجیمون ویروسی شیطانی با موفقیت فرزندان انتخاب شده اصلی را ربود. دوستان کوچکتر آنها باید با شرکای دیجیمون خود با زمان مسابقه دهند تا منبع این تهدید جدید را کشف کنند و شاید یک معمای چند ساله را حل کنند.
