با گزارش‌هایی مبنی بر وحشت هیولاها در رآکتور در کوه نیبل، شرکت برق Shinra، نیروی رزمی نخبه خود، SOLDIER را برای تحقیق اعزام می‌کند. قهرمان جنگ سپیروث با همراهی همکار زاک فرست کلاس SOLDIER و گروه کوچکی از نگهبانان شرکت، قرار است وضعیت راکتور ماکو را به دستور شرکت ارزیابی کند. در نیبلهایم، دهکده‌ای که راکتور نیرو می‌دهد، سپیروث منبع هیولاها و سرچشمه پروژه افسانه‌ای جنوا شینرا را کشف می‌کند.
زک که ماه‌ها بعد در جنگل می‌دوید، دیگر قهرمانی نیست که زمانی آرزویش را داشت. او از اداره امور عمومی شرکت برق شینرا، معروف به ترک‌ها، فرار می‌کند، که ناامیدانه به دنبال دفن شواهد زندگی در درون این دو هستند.
