دو سال از پایان چهارمین جنگ بزرگ نینجا می گذرد. کونوهاگاکوره در حالت صلح و هماهنگی باقی مانده است - تا اینکه هوکاگه کاکاشی هاتاکه ششم متوجه شد که ماه به طور خطرناکی به زمین نزدیک می شود و خطر نابودی سیاره را به همراه دارد.
در میان این مصیبت بزرگ، کونوها توسط شیطان جدیدی به نام تونری اوسوتوسکی مورد تهاجم قرار می گیرد که به طور ناگهانی خواهر کوچک هیناتا هیوگا، هانابی را می رباید. کاکاشی یک تیم نینجا ماهر متشکل از ناروتو اوزوماکی، ساکورا هارونو، شیکامارو نارا، سای و هیناتا را اعزام می کند تا هانابی را از چنگال شیطانی تونری نجات دهند. با این حال، تیم در طول ماموریت خود با موانع متعددی روبرو می شود که آنها را به چالش می کشد و تلاش آنها را ناکام می گذارد.
با ربوده شدن او، روابطی که این تیم با یکدیگر به اشتراک می گذارند مورد آزمایش قرار می گیرد و با رسیدن جهان به مرز نابودی، آنها باید با زمان مسابقه دهند تا از ایمنی سیاره خود اطمینان حاصل کنند. در همین حال، با شروع نبرد، ناروتو رانده می‌شود تا برای چیزی بزرگ‌تر از آنچه تصور می‌کرده است بجنگد - عشق.
