در حالی که داستان اصلی Mobile Suit Gundam SEED بر روی مبارزات بین Earth Alliance، ZAFT و Orb Union متمرکز است، سری Astray بر روی سه نمونه اولیه لباس موبایل MBF-P0x (البته عمدتاً در Lowe Guele) و خلبانان مربوطه متمرکز شده است. سازمان هایی که عمدتاً در حومه خط داستانی اصلی SEED وجود دارند. MBF-P02 Astray Red Frame توسط Lowe Guele از انجمن Junk Guild هدایت می شود و MBF-P03 Astray Blue Frame توسط Gai Murakumo از گروه مزدور Serpent Tail هدایت می شود. سومین Astray، MBF-P01 Astray Gold Frame، توسط آنتاگونیست اصلی داستان Astray، اشراف Orb، Rondo Ghina Sahaku، و بعدا توسط خواهر دوقلوی او Rondo Mina Sahaku هدایت می شود.
