پس از اتمام کار در تحقیق کلونی مندل، یک لباس موبایل مرموز به مستعمره نزدیک می شود - احتمالاً با قصد خصمانه. هنگامی که Low Gear در Red Frame رهگیری می کند، خلبان آتش می زند... و بنابراین ماجراجویی هیجان انگیز دیگری را در دنیای محبوب Gundam Seed آغاز می کند! Mobile Suit Gundam SEED X Astray از جایی که Gundam Seed Astray R متوقف شد ادامه می یابد!