espers شهر آکادمی به شش سطح طبقه بندی می شود، که در آن "سطح 0" فاقد قدرت است در حالی که "سطح 5" دارای مقدار قابل توجهی است. از بین چندین میلیون اسپری ساکن در شهر آکادمی، تنها هفت نفر از آنها به سطح 5 رسیده اند و بالاترین رتبه در میان آنها یکی است که به عنوان شتاب دهنده شناخته می شود. Toaru Kagaku no Accelerator پس از محافظت از Last Order شاد به قیمت بیشتر قدرت خود، روی قوی ترین سطح 5 تمرکز می کند. شتاب دهنده در حال بهبودی در بیمارستان، زندگی نسبتاً آرامی را سپری می کند تا اینکه در نهایت جان استل روزنتال، دختری مرموز را که عکسی از آخرین سفارش را حمل می کند، نجات می دهد. متأسفانه، Accelerator اکنون خود را درگیر یک درگیری جدید در قالب یک سازمان شوم به نام اقدام انضباطی می‌یابد که قصد دارد از آخرین دستور برای یک مأموریت خطرناک استفاده کند. اکنون که آنها نقشه خود را به اجرا گذاشته اند و در تعقیب دختر جوان هستند، این به قدرتمندترین اسپر جهان و همراه تازه یافته اش بستگی دارد که از Last Order محافظت کنند و از شهر آکادمی در این روند دفاع کنند.
