تنش‌های نبردهای انتخابگر ظاهراً ناپدید شده‌اند و شرکت‌کنندگان باقی‌مانده به سرعت کل مصیبت را پشت سر گذاشته‌اند. با این حال، کیوی میزوشیما احساس می کند که درگیری هنوز پایان نیافته است. علیرغم شکست کو ساتومی، حامیان او در حال حاضر تلاش می کنند تا برنامه های او را در پس زمینه احیا کنند.
طولی نمی کشد که شک میزوشیما صحت دارد. نه تنها سیستم نبرد Selector دوباره ظاهر می شود، بلکه یک مکانیک جدید نیز پیاده سازی شده است. بازیکنان یک کارت کلید ویژه دریافت می کنند که با سکه های طلا باز می شود و قدرت پنهانی را آزاد می کند. میزوشیما با آگاهی از دشمنان مهیب پیش رو، شروع به جستجوی متحدان ماهر در تلاش خود برای شکستن چرخه تاریکی می کند.
