در کف اقیانوس، لوپین بار دیگر به دنبال گنجی است به این امید که بتواند طرف خوب فوجیکو را بگیرد. همانطور که Zenigata آنها را در دریا و خشکی تعقیب می کند، افراد اطراف باند به طور مرموزی ناپدید می شوند. مه غلت می زند و مامو کیوسوکه در یک انفجار نور ظاهر می شود. او ادعا می کند که از آینده است و به دنبال کاری که لوپین سیزدهم با او انجام داده است، از لوپین سوم انتقام می گیرد. مامو لوپین، جیگن، گومون و زنیگاتا را 500 سال به گذشته پرتاب می کند. در حالی که دو جناح متخاصم بر سر زیارتگاهی افسانهای که به سفر در زمان اختصاص دارد با هم میجنگند، لوپین باید راهی برای زنده ماندن از گذشته بیابد تا آیندهاش را تضمین کند.
این فیلم بازسازی قسمت 13 از سری اصلی Lupine III است.