دیجیمون‌های آلوده - هیولاهای دیجیتالی که شروع به رفتار دیوانه‌وار کرده‌اند و افزایش عجیبی در قدرت را تجربه کرده‌اند - در حال هجوم به دنیای واقعی هستند. در حالی که ماکی هیمکاوا و دایگو نیشیجیما، عوامل آژانس اداری مرموز، تلاش می‌کنند تا در مورد این ظواهر مخرب اطلاعات بیشتری کسب کنند، اکثر کودکان انتخاب شده مشغول آماده‌سازی برای جشنواره تابستانی دبیرستان عمومی تسوکیشیما هستند.
میمی تاچیکاوا که اخیراً پس از سال‌ها زندگی در ایالات متحده به ژاپن بازگشته است، تلاش می‌کند تا جای خود را در میان همکلاسی‌هایش و فرزندان برگزیده‌اش پیدا کند. در همین حال، جو کیدو با انداختن خود به تحصیلاتش، عمداً از همه مسائل مربوط به دیجیمون دوری می‌کند و باعث فرار شریک زندگی او گومامون شده است. اقدامات فردی میمی و جو باعث ایجاد اصطکاک در بین گروه می شود، حتی در حالی که تهدید دیجیمون آلوده هنوز بر سر آنها وجود دارد. آیا این دو درگیری های شخصی خود را به موقع حل می کنند تا به دوستانشان کمک کنند تا با آخرین تهدید مقابله کنند؟
