با وحشت Meiko Mochizuki، شریک Digimon او Meicoomon مجبور می شود به Meicrackmon تبدیل شود و در این روند تحت تأثیر شیطانی قرار می گیرد. همانطور که Meicrackmon ناپدید می شود تا در جاهای دیگر ویران کند، به نظر می رسد که دنیای دیجیتال خود شروع به رد حضور Meiko و سایر فرزندان برگزیده می کند. گروه در حالی که از دشمنان مختلفی که به دنبال آنها می آیند فرار می کنند، سعی می کنند راه بازگشت به خانه را پیدا کنند.
در دنیای انسان، یک پیام آور از موجودیت اسرارآمیز هوموستاز، هم پدر میکو و هم دایگو نیشیجیما از آژانس اداری ثبت شده را ملاقات می کند تا در مورد منشاء میکومون صحبت کند. پیام رسان به آن دو اطلاع می دهد که Homeostasis قصد دارد هیولای دیجیتال را از بین ببرد. با انجام این کار، آنها امیدوارند که از تحقق بیشتر Digimon در قلمرو انسانی جلوگیری کنند - صرف نظر از احساسات فرزندان برگزیده در مورد این موضوع.
